Margrethe Vestager har allerede sager kørende mod Google og Gazprom, skriver Berlingske Nyhedsbureau.
Ifølge dokumenter fra sagen Luxleaks, skulle Ikea også have fået skatterabatter i Luxembourg.
Koncernchef for Ikea, Peter Agnefjäll, var inviteret til et møde i Bruxelles, men han takke nej.
Bolighuset er dog ikke afvisende overfor et fremtidig samarbejde med EU, siger kædens talsmand David Affentranger.
Virksomheder som Google, Amazon og Facebook har også takket nej til invitationen om et møde i Bruxelles.